Afbeelding
Inhoud van de minor
De kern van de minor is een groot project waarvoor je kan kiezen uit verschillende onderwerpen. Daarnaast volg je hoorcolleges, werkcolleges en practica waarin je de technieken leert die je nodig hebt tijdens het project.
Waterschap Friesland
• We werken samen met het Waterschap Friesland aan environmental DNA (eDNA). Met de nieuwste sequencing techniek, nanopore sequencing, bepalen we op basis van DNA-sporen in water welke organismen er aanwezig zijn.
Plantenveredeling
• In samenwerking met een plantenveredelaar doen we onderzoek naar het microbioom (de complete set aan micro-organismen) van aardappels. We analyseren de microbiomen van planten uit een veldexperiment. We onderzoeken de effecten van verschillende genotypes en stikstofbehandelingen op de samenstelling van micro-organismen.
Evolutie
• Nonribosomale peptide synthetasen zijn enzymen die onder andere gebruikt worden om cytostatica en antibiotica (zoals penicilline) te produceren. In micro-organismen komen deze enzymen veel voor maar we weten pas sinds kort dat ze ook in dieren wijdverspreid zijn. In dit onderzoek probeer je te achterhalen of deze enzymen in dieren van nature voorkomen of dat ze uit de genomen van micro-organismen zijn overgesprongen.
Darmflora van mensen
• In een dataset met personen die wel of geen antibioticum hebben gebruikt, kijken we of de darmflora wordt verstoord door het gebruik van antibiotica.
Opzet van de minor
De minor bestaat uit de volgende onderdelen:
• Project (15 EC)
Je kan kiezen uit projecten op verschillende vakgebieden zoals waterbeheer, plantenveredeling, ecologie, evolutie en procestechniek. Je mag zelf kiezen aan welk project je tijdens de minor werkt. Bij meerdere projecten werken we samen met bedrijven of overheidsinstanties. Tijdens de minor bieden we ook verschillende excursies aan zodat je het werkveld beter leert kennen.
• Data-analyse in R (5 EC)
Je leert werken met het programma R, één van de meest gebruikte programma’s voor de analyse van biologische gegevens (DAS, 2021). Kennis van R wordt veel gevraagd door werkgevers. We gebruiken R om je data te analyseren en professionele figuren te maken.
• Data stewardship (5 EC)
De opslag en het beheer van grote datasets kan best lastig zijn. Voor bedrijven is het soms ingewikkeld om hier goed mee om te gaan. Daarom leren we je hoe je ervoor zorgt dat je gegevens duidelijk en herbruikbaar zijn voor je collega’s.
• Biologische data-analyse (5 EC)
In dit onderdeel leer je de meest gebruikte analysetechnieken voor biologische datasets.
